Neizravna diskriminacija nastaje kada naizgled neutralna odredba, kriterij ili praksa ne izgledaju diskriminatorno, ali imaju diskriminatorni učinak tijekom provedbe, stavljajući osobu u nepovoljniji položaj u usporedbi s drugima, osim ako ta odredba, kriterij ili praksa nije objektivno opravdana legitimnim ciljem, a sredstva za postizanje tog cilja prikladna su i nužna.
U rujnu 2023. godine, IPC je prijavio slučaj neizravne diskriminacije Pučkoj pravobraniteljici nakon saznanja o postojanju takve prakse, a odnosi se na navođenje nacionalnosti u svjedodžbama. Diskriminacijska osnova je rasa ili etnička pripadnost te boja kože/nacionalno podrijetlo. Prema Pravilniku o sadržaju i obliku svjedodžbi i drugih javnih isprava te pedagoškoj dokumentaciji i evidenciji u školskim ustanovama (NN br. 32/10) iz 2010. godine, narodnost se više ne navodi u svjedodžbama novijeg datuma. Međutim, osobe kojima su svjedodžbe izdane prije toga datuma, i dalje ima svoju nacionalnost navedenu na svjedodžbi, što je IPC prepoznao kao neizravnu diskriminaciju, a isto je potvrdila i Pučka pravobraniteljica u svojoj preporuci Ministarstvu znanosti i obrazovanja.
Romi su često izloženi predrasudama i socijalnoj distanci, te su stoga skupina koja se najčešće suočava s diskriminacijom. U ovom slučaju, vjerojatnost je da žrtva, kao kandidat zaposlenja, neće biti pozvana na razgovor za posao jer je u svjedodžbi navedena njezina romska nacionalnost. U području rada i zapošljavanja, ova skupina često doživljava diskriminaciju jer 28% građana vjeruje da bi Romi zaposleni u uslužnim djelatnostima vjerojatno odbijali klijente. Ne iznošenje nacionalnosti ima za cilj promicanje ravnopravnosti svih građana RH, bez obzira na nacionalnu pripadnost, te bi uključivanje podataka o nacionalnosti na svjedodžbama moglo doprinijeti stigmatizaciji, marginalizaciji ili diskriminaciji pojedinca na temelju njihovog porijekla. Školske svjedodžbe trebale bi sadržavati relevantne informacije o uspjehu učenika i njihovim postignućima relevantnim za njihovo sudjelovanje na tržištu rada, a ne nacionalne pripadnosti.
